Perushe Rabenu Yehonatan mi-Lunel : ʻal 21 masekhtot ha-Shas ... mugahim ʻal pi kitve-yad. Ṿe-nilṿu el ha-ḳodesh Ḥitse Yehonatan : perush ʻal Rabenu Yehonatan le-Masekhet ʻEruvin / me-Rabenu Yaʻaḳov Meʼir Padoṿah. Heʻarot ha-g.m. Rabi Yeḥezḳel ʻEzra Raḥamim ... mi-Bagdad : ʻal Rabenu Yehonatan le-Masekhet Sukah. Bet Yehonatan : mavo ṿe-toladot.
פירושי רבינו יהונתן מלוניל על כ״א מסכתות הש״ס ... מוגהים על פי כתבי־יד. ונלוו אל הקודש חצי יהונתן : פירוש על רבינו יהונתן למסכת עירובין / מרבינו יעקב מאיר פאדוואה. הערות הג״מ רבי יחזקאל עזרא רחמים ... מבגדד : על רבינו יהונתן למסכת סוכה. בית יהונתן : מבוא ותולדות.